A partir du printemps 1918, la ville de Noyon est bombardée par les alliés. Elle connait 80% de destructions et la gare n’échappe pas au désastre. Comme bon nombre de gares de France constituant un point stratégique en matière de ravitaillement et de communication, elle fut incendiée.

Après-guerre, la ville de Noyon s’offre une nouvelle gare de style Art Déco propre à la Belle époque. La bâtisse sera l’œuvre d’Urbain Cassan, célèbre architecte qui réalisera, entre autres, la gare Art Déco de Lens, la gare de Saint-Quentin, la gare de Senlis ou l’hôpital Claude Huriez à Lille.